Основными загрязнителями города Балхаша являются горно-металлургические предприятия цветной металлургии. Самым крупным и градообразующим из них является ПО «Балхашцветмет» (ранее Балхашский Горно-Металлургический Комбинат (БГМК). Также свою лепту в состояние окружающей среды города и озера Балхаш вносит Завод по обработке цветных металлов, который специализируется на выпуске плоского и круглого проката на основе медных сплавов. Собственником которого в настоящее время является корпорация «Казахмыс».
Вполне логично предположить, что основными загрязнителями Балхаша будут медь, свинец, цинк, кадмий, мышьяк – вещества, связанные с переработкой руд и выплавкой цветных металлов.