Хвостохранилище oзеро Кошкар Ата расположено в 5 км от города Актау и в 8 км от берега Каспийского моря, его площадь составляет примерно 50 км2. Еще во время Советского Союза в Казахстане были обнаружены месторождения урана. И в 1980-е годы в Казахстане производилось более трети всего объема советской урана, более, чем на тридцати урановых рудниках. Бывшая котловина Кошкар-Ата оказалась удобным местом для размещения радиоактивных и токсичных отходов химико-гидрометаллургического комплекса недавно основанного города Шевченко, ныне Актау, с населением в 176 тысяч жителей. Южная часть озера подверглась радиационному заражению. В 1999 году в связи с изменениями военных приоритетов добыча урана была прекращена. Тем не менее, озеро иногда еще используется в качестве места захоронения коммерческих и производственных отходов, нефтешлама и пр. Трубопроводы многих предприятий подведены к озеру, берега которого зачастую покрыты огромным количеством мусора. Так как в Мангистау очень мало источников питьевой воды, то животные (например, лошади и верблюды) приходят сюда в поисках воды, на водопой. Молоко и мясо таких животных может содержать целый «букет» химических веществ. Это безусловно требует дополнительно исследования. В 2014 году акимат Мангистауской области уже провел первое исследование грызунов живущих в районе озера и были установлены факты изменения состава ДНК на генетическом в виде мутации. Исследования предполагается будут продолжены.
Высокая испаряемость и недостаток воды могут стать причиной полного высыхания озера в будущем. Южная часть Кошкар-Аты (около 13 км2) с высокой концентрацией загрязняющих веществ, твердых отходов и высоким уровнем радиации уже обезвожена. Постоянно дующий сильный ветер, характерный для данной местности, разносит опасные зараженные частицы на значительные расстояния.
Местные власти в большей степени озабочены возможным загрязнением Каспийского моря грунтовыми водами, содержащими ядовитые соединениями. Однако, нет никаких доказательств того, что море уже было загрязнено. Согласно данным мониторинга, в настоящее время повышенный уровень загрязнения грунтовых вод и почвы ограничивается областью, шириной 2-4 км вокруг озера.
Не смотря на то, что проблема настоящего хвостохранилища является существенной для региона, местная администрация предпринимает усилия по восстановлению окружающей среды и ликвидации проблемы. В частности в 2009 и 2010 гг были проведены первые работы по рекультивации особо опасных радиационных участков данного озера. На сегодняшний день, акимат области завершил разработку ТЭО, получив положительное заключение государственной экспертизы, готовит ПСД для обоснования расходов рекультивации Хвостохранилища и проводит процедуру передачи данного объекта в собственность земель республиканского значения.
